草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿系統最应见的重大疾病中的一种。肾企业中CaOx硫化锌过达到饱和状态积聚会出现肾小管体细胞受伤和凋亡，而出现肾结石的达成。短链脂肪的的酸由胃肠内水解酸化池杆菌发酵法伙食黏胶纤维带来，除了在轮廓线胃肠天然屏障中引领功用，甚至在系統总体水平上也引领首要功用。在其中，丁酸是最丰厚的短链脂肪的的酸，极具抗感染和免疫系统减缓功用,本研究方案一起探讨丁酸对CaOx肾结石的功用十分不确定靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院口腔科泌尿产科吴忠教受、周子健教授于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教导、周子健硕士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网格药学学保障，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

句子分类：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 买家公司：华山医阮 探索物体：大鼠、HK-2肿瘤细胞 分成小组信息：对应组（Con）、模板组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱能提供高技术：网路药理学学监测

策略步骤图

论述导致

论述人士前提是在校园营销推广活动的环节之中所构建大鼠沙盘三维3d模型，完成生活生化模式完成指标和组建病检学复染等论述技术找到丁酸就能够下降CaOx沙盘三维3d模型大鼠肾CaOx硫化锌的养成和破损，有效改善CaOx沙盘三维3d模型大鼠的支原体感染破损和硫化类物质的过度紧张表达出。凡此种种，丁酸还可调控草酸促进的HK-2血人体细胞破损、硫化应激反应和血人体细胞凋亡。 为研究探讨性丁酸的格局和靶dna网洛，研究探讨技术人员从PubChem提高丁酸和丁酸酯的二维和三维空间的格局（图1A）。按照PharmMapper统计资料库查询表格库和Uniprot统计资料库查询表格库治理 后共淘汰出117个丁酸靶dna供逐渐一个脚印定性定性具体分析。将dna全部使用STRING统计资料库查询表格库，去PPI网洛定性定性具体分析。Cytoscape给予了排列的前20的核心区靶dna的详细完整网洛图，涉及CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。那些核心区dna与网洛中的许多dna均具体表现出特定的涉及到的性，介绍那些dna将会充分起到着协作意义。GO和KEGG定性定性具体分析论述了丁酸核心区dna的涉及到的经过和生态学学技能（图1C）。核心区dna核心的与类固醇抗生素回应、腐蚀症状应激性症状回应、化学活化酶氧组织对类固醇抗生素刺激到的症状包括对弱酸性化学材料材料的症状相关联。总而言之所写，那些核心区dna核心的进行了腐蚀症状应激性症状和对化学活化酶氧的生态学症状的时候，是肾结石构成逻辑中至关非常根本的经过，这是因为丁酸将会在肾结石中充分起到非常根本意义。

图1| 丁酸结构特征与靶基因组网洛研究(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为逐渐一个脚印探讨丁酸对CaOx肾结石事实上切靶dna组，研发者实现GEO资料库对GSE73680中健康的相较比较与CaOx肾结石患病者的dna组对比剖析实现了研发。相较比较组与CaOx结石患病者的重要性对比剖析表示dna组（DEGs）检查规范标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个dna组的发生重要发生改变，这当中3379个（89.4%）dna组表示上涨，404个（10.6%）dna组表示调整（图2A）。对DEGs实现聚类分析法算法剖析，热图展现了前10个被选中DEGs的二维分层次聚类分析法算法表现（图2B）。己经，研发者实现GeneCards资料库人工控制鉴别了370个概率与CaOx肾结石相应的的dna组，排在前20位的分折dna组基本相应的性打分如同2C提示。要为找丁酸制疗CaOx肾结石的主要靶点，研发者将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应的dna组治疗取到一个Venn图。既定，CYP2C9被来确定为丁酸引响CaOx肾结石的内在靶点(图2D)。与此同时，研发者还实现了丁酸与CYP2C9的原子交接，CYP2C9的这三个有机酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸双方角色，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在借助微信网络药剂学学预測CYP2C9是丁酸影响力CaOx肾结石的靶染色体后，研发拜谱生物还在细胞核膜實驗否认了CYP2C9可大大减少草酸诱骗的HK-2细胞核膜的ROS水平面、细菌感染损坏和凋亡。

图2| 很多据库协力深入分析预测分析CYP2C9是丁酸能力于CaOx肾结石的靶表观遗传

论述后果

本分析首选遇到丁酸在身体外和体中均能压制性CaOx肾结石建模的钝化应激状态状态和慢性慢性炎症病变受伤，随即实现网药学学建立获取丁酸影响到CaOx肾结石的隐藏的靶点——CYP2C9，最终实现组织体细胞研究否认CYP2C9在草酸盐帮助的HK-2组织体细胞ROS标准、慢性慢性炎症病变受伤和凋亡。他们遇到显示丁酸有机会实现压制性CYP2C9来压制性CaOx肾结石的钝化应激状态状态，可减轻慢性慢性炎症病变受伤。这一项整个过程中拜谱生态学给出了网药学学高技艺工作，虽然拜谱生态学可提供成熟稳重健全完善的染色体组学、蛋白酶质组学、分解组学等两组学的产品及高技艺工作，欢迎会打电话咨询了解！ 决定性医学文献：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.