
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物技术 为其提供 TMT蛋白质组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探究结局
探索工作人员来探寻跟随冰箱精力拉长鸡肉的抗拉强度、持水力发电、有光泽度、徘徊铁含碳量、ROS、脂质过阳极化合物、MDA、GSH和GPX4的水平来风险评估相关肌肉组建内部膜的铁枯死情况。结果提示 提示 ,冰箱精力拉长后,鸡肉的抗拉强度在第5天和第6天同质性急剧下降;持水特性变低;色泽变深,失有光泽度,鲜鲜桔红色改为暗鲜桔红色。凡此种种,徘徊铁、可溶性氧和MDA的含碳量同质性加剧,内部膜凋亡率同质性增大。 设计人工生成的有所的差异冷冻箱耗时的胸肌原材料的核球蛋清酶质,但是进行SDS-PAGE介绍,核球蛋清酶质条带在的有所的差异时地域分布平均且同类(图1a)。基于核球蛋清酶在的有所的差异原材料中的抒发情況,介绍察觉到同时组原材料的中数字快要于同时关卡(图1b),介绍胸肌原材料核球蛋清酶质具备有比较好的组内同类性和组间的差男人。 蛋清质组学共评定出1996种蛋清质。以B0为比对组,需求B1、B2、B4和B6中的蛋清做差别的表答浅析,共评定到376个DEPs。将火山图可视化效果,并选择FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05几个标准规范浅析DEP。效果图甲1c-f如图是,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别评定出22、33、73和140个DEPs,在这其中分头别调涨6、11、32和87个,下跌16、22、41和5多个。聚类分析工艺估评了不同于冷冻价段全身肌肉群安排中蛋清质的表答,效果彰显全身肌肉群蛋清表答差别的近年来贮藏时间段的延长而延长(图1g)。
图1| 有所差异冷冻冷藏时长的肌试品蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一冷冻箱时段的健身肌肉土样的差异核蛋白阐述(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁窒息死亡血清肽的PRM按量研究(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 应用场景KEGG丰度对比展示蛋白酶的铁死掉机理(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱怪物提供了TMT一定量球蛋白酶质组学技術应用服务项目性,拜谱生物制品已研发项目管理完毕并形成了健全成熟期的转录组学、球蛋白酶组学、分解组学已经两组学联和类产品技術应用服务项目性组织体制,欢迎致电咨询!
参看专著:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.